En alsidig mikroorganisme med utrolig potentiale
Mikroorganismen Escherichia coli har en lang brugshistorie i bioteknologibranchen og er stadig den valgte mikroorganisme til de fleste genkloningforsøg. Selv om E. coli er kendt for den generelle befolkning for den infektiøse karakter af en bestemt stamme (0157: H7), er få mennesker opmærksomme på, hvor alsidig og nyttig E. coli er for genetisk forskning. Der er flere grunde, at E. coli blev så vidt anvendt og stadig er en fælles vært for rekombinant DNA.
01 Genetisk Simplicitet
02 vækstraten
Bakterier vokser typisk meget hurtigere end mere komplekse organismer. E. coli vokser hurtigt med en hastighed på en generation pr. Tyve minutter under typiske vækstbetingelser. Dette gør det muligt at forberede kulturer i logfasen (mellemvejs til maksimal tæthed) natten over, og genetiske eksperimentelle resultater resulterer i blot timer i stedet for flere dage, måneder eller år. Hurtig vækst betyder også bedre produktionshastigheder, når kulturer anvendes i opskalede fermenteringsprocesser .
03 Sikkerhed
E. coli findes naturligt i tarmkanalerne hos mennesker og dyr, hvor det hjælper med at levere næringsstoffer (vitaminer K og B12) til dets vært. Der er mange forskellige stammer af E. coli, der kan producere toksiner eller forårsage varierende infektionsniveauer, hvis de indtages eller får lov til at invadere andre dele af kroppen. På trods af den dårlige omtale af en særlig giftig stamme (O157: H7) er E. coli generelt relativt uskadelig, hvis de håndteres med rimelig hygiejne.
04 E. Coli-genomet er godt forstået
E. coli- genomet var den første, der blev fuldstændigt sekventeret (i 1997). Som et resultat er E. coli den mest studerede mikroorganisme. Avanceret viden om dens proteinekspressionsmekanismer gør det lettere at anvende til forsøg, hvor ekspression af fremmede proteiner og udvælgelse af rekombinanter er afgørende.
05 Evne til at være vært for udenlandsk DNA
De fleste genkloningsteknikker blev udviklet ved anvendelse af denne bakterie og er stadig mere succesfulde eller effektive i E. coli end i andre mikroorganismer. Som følge heraf er forberedelse af kompetente celler (celler, som vil optage fremmed DNA) ikke kompliceret. Transformationer med andre mikroorganismer er ofte mindre succesrige.
06 E Coli er nem at passe på
Fordi det vokser så godt i den menneskelige tarm, finder E. coli det let at dyrke, hvor mennesker kan arbejde. For eksempel:
- Det er mest behageligt ved kropstemperatur. Mens 98,6 grader kan være lidt varm for de fleste, er det nemt at opretholde den temperatur i laboratoriet.
- E. coli lever i den menneskelige tarm, hvilket betyder, at det ikke er kræsen om sin mad. I det væsentlige er det glade for at forbruge enhver form for fordøjet fødevare.
- Det kan vokse både aerobt og anaerobt. Således kan den formere sig i tarm af et menneske eller dyr, men er lige så glad i en petriskål eller kolbe.